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Registros recuperados : 26 | |
2. | | PEIXOTO, R. S.; CHAER, G. M.; FRANCO, N.; REIS JUNIOR, F. B. dos; MENDES, I. de C.; ROSADO, A. S. A decade of land use contributes to changes in the chemistry, biochemistry and bacterial community structures of soils in the Cerrado. Antonie van Leeuwenhoek, v. 98, n. 3, p. 403-413, 2010. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Cerrados. |
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4. | | LEITE, D. C. A.; BALIEIRO, F. C.; C. A. PIRES; MADARI, B. E.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. C.; PEIXOTO, R. S. Comparison of DNA extraction protocols for microbial communities from soil treated with biochar. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 45, n. 1, p. 175-183, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Solos. |
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5. | | RACHID, C. T. C. de C.; BALIEIRO, F. de C.; PEIXOTO, R. S.; CHAER, G. M.; PICCOLO, M. de C.; ROSADO, A. S. Changes in soil microbial community and nitrogen cycling in mixed plantations of Eucalyptus urograndis and Acacia mangium culminates in soil nitrate increase. INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MICROBIAL ECOLOGY, 14., 2012, Conpenhague, DE. The power of the small: abstracts... Wageningen, NE:The International Society for Microbial Ecology, 2012. ISME14 Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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6. | | LEITE, D. C. de A.; BALIEIRO, F. de C.; PIRES, C. de A.; MADARI, B. E.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. da C.; PEIXOTO, R. S. Efeito de diferentes tipos de biomassa carbonizada (biocarvão) nas comunidades de bactérias e fungos associados às rizosferas de plantas de arroz (Oryza sativa) cultivar BRSMG curinga. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos. Resumos [...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Associação Latinoamericana de Microbiologia, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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7. | | RACHID, C. T. C. C.; SANTOS, A. L.; PICCOLO, M. C.; BALIEIRO, F. C.; COUTINHO, H. L. C.; PEIXOTO, R. S.; TIEDJE, J. M.; ROSADO, A. S. Effect of sugarcane burning or green harvest methods on the brazilian cerrado soil bacterial community structure. Plos One, v. 8, n. 3, e59342, Mar. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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8. | | TEIXEIRA, L. C. R. S.; YEARGEAU, E.; BALIEIRO, F. de C.; PICCOLO, M. C.; PEIXOTO, R. S.; GREER, C. W.; ROSADO, A. S. Plant and bird presence strongly influences the microbial communities in soils of admiralty bay, maritime antarctica. Plos One, v. 8, n. 6, jun. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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9. | | LEITE, D. C. de A.; BALIEIRO, F. de C.; MADARI, B. E.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. da C.; PEIXOTO, R. S. Quantificação de genes-chave relacionados ao ciclo de nitrogênio microbiano em rizosfera plantas de arroz (Oryza sativa) cultivar BRSMG curinga tratadas com diferentes tipos de biocarvão. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos. Resumos [...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Associação Latinoamericana de Microbiologia, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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10. | | FONSECA, E. da S.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S.; BALIEIRO, F. de C.; TIEDJE, J. M.; RACHID, C. T. C. da C. The microbiome of Eucalyptus roots under different management conditions and its potential for biological nitrogen fixation. Microbial Ecology, v. 75, n. 1, p. 183-191, 2018. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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11. | | RACHID, C. T. C. C.; BALIEIRO, F. de C.; PEIXOTO, R. S.; PINHEIRO, Y. A. S.; PICCOLO, M. C.; CHAER, G. M.; ROSADO, A. S. Mixed plantations can promote microbial integration and soil nitrate increases with changes in the N cycling genes. Soil Biology & Biochemistry, v. 66, p. 146-153, Nov. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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12. | | RACHID, C. T. C. C.; BALIEIRO, F. de C.; PEIXOTO, R. S.; PINHEIRO, Y, A. S.; PICOLLO, M. C.; CHAER, G. M. Mixed plantations can promote microbial integration and soil nitrate increases with changes in the N cycling genes. Soil Biology & Biochemistry, v. 66, p. 146-153, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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13. | | LEITE, D. C. A.; BALIEIRO, F. de C.; LEITE, L. F. C.; MADARI, B. E.; RIBEIRO, A. de F.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S. Integrated crop-livestock-forest system presents a different soil microbial structure in comparison to other land uses. In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FOREST SYSTEMS; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK SYSTEMS, 3., 2015, Brasília, DF. Towards sustainable intensification: proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio-Norte. |
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14. | | LEITE, D. C. A.; BALIEIRO, F. de C.; LEITE, L. F. C.; MADARI, B. E.; RIBEIRO, A. de F.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S. Integrated crop-livestock-forest system presents a different soil microbial structure in comparison to other land uses. In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FOREST SYSTEMS; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK SYSTEMS, 3., 2015, Brasília, DF. Towards sustainable intensification: proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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15. | | RACHID, C. T. C. C.; BALIEIRO, F. C.; FONSECA, E. S.; PEIXOTO, R. S.; CHAER, G. M.; TIEDJE, J. M.; ROSADO, A. S. Intercropped silviculture systems, a key to achieving soil fungal community management in eucalyptus plantations. Plos One, v. 10, n. 2, Feb. 2015. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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17. | | PEIXOTO, R. S.; COUTINHO, H. L. C.; MADARI, B.; MACHADO, P. L. O. A.; RUMJANEK, N. G.; VAN ELSAS, J. D.; SELDIN, L.; ROSADO, A. S. Soil aggregation and bacterial community structure as affected by tillage and cover cropping in the Brazilian cerrados. Soil & Tillage Research, Amsterdam, v. 90, n. 1-2, p. 16-28, nov. 2006. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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18. | | PIRES, C. A.; LEITE, D. C. A.; COSTA, C. T. R. C.; ANGELINI, G. A. R.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. C.; ZANATTA, J.; SALTON, J.; BALIEIRO, F. C. Impacto de diferentes níveis de palhada de cana-de-açúcar sobre comunidade fúngica total de latossolo do cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas: anais. [Uberlândia]: SBCS: UFU, ICIAG, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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19. | | RACHID, C. T. C. da C.; LEITE, D. C. de A.; COUTINHO, H. L. da C.; BALIEIRO, F. de C.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, R. S.; PICCOLO, M. de C. Impacto da cana na comunidade de desnitrificantes, fluxo de N20 e potencial de desnitrificação do solo de cerrado. In: SIMPÓSIO CIENTÍFICO DOS PÓS-GRADUANDOS NO CENA/USP, 2., 2009, Piracicaba, SP. Anais... Piracicaba, SP: USP, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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20. | | RACHID, C. T. C. da C.; LEITE, D. C. de A.; CAVALINI, R. M.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S.; BALIEIRO, F. de C.; PICCOLO, M. de C.; COUTINHO, H. L. da C. Estrutura da comunidade bacteriana e agregação do solo sob cerrado e cana-de-açúcar em Goiás. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... São Paulo: SBM, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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Registros recuperados : 26 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Solos. Para informações adicionais entre em contato com cnps.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Solos. |
Data corrente: |
20/09/2021 |
Data da última atualização: |
25/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
Internacional - A |
Autoria: |
PEIXOTO, R. S.; COUTINHO, H. L. da C.; RUMJANEK, N. G.; MACRAE, A.; ROSADO, A. S. |
Afiliação: |
R. S. PEIXOTO, UFRJ; HEITOR LUIZ DA COSTA COUTINHO, CNPS; NORMA GOUVEA RUMJANEK, CNPAB; A. MACRAE, UFRJ; A. S. ROSADO, UFRJ. |
Título: |
Use of rpoB and 16S rRNA genes to analyse bacterial diversity of a tropical soil using PCR and DGGE. |
Ano de publicação: |
2002 |
Fonte/Imprenta: |
Letters in Applied Microbiology, v. 35, n. 4, p. 316-320, Oct. 2002. |
DOI: |
https://doi.org/10.1046/j.1472-765X.2002.01183.x |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Aim: To evaluate the rpoB gene as a biomarker for PCR-DGGE microbial analyses using soil DNA from the Cerrado, Brazil. Methods: DNA extraction from soil was followed by Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification of rpoB and 16S rRNA genes. PCR products were compared by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) to compare gene/community profiles. Results: The rpoB DGGE profiles comprised fewer bands than the 16S rDNA profiles and were easier to delineate and therefore to analyse. Comparison of the community profiles revealed that the methods were complementary. Conclusions, Significance and Impact of the Study: The gene for the beta subunit of the RNA polymerase, rpoB, is a single copy gene unlike 16S rDNA. Multiple copies of 16S rRNA genes in bacterial genomes complicate diversity assessments made from DGGE profiles. Using the rpoB gene offers a better alternative to the commonly used 16S rRNA gene for microbial community analyses based on DGGE. |
Palavras-Chave: |
DNA extraction. |
Thesaurus NAL: |
Polymerase chain reaction; Tropical soils. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
Marc: |
LEADER 01684naa a2200217 a 4500 001 2134559 005 2023-08-25 008 2002 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1046/j.1472-765X.2002.01183.x$2DOI 100 1 $aPEIXOTO, R. S. 245 $aUse of rpoB and 16S rRNA genes to analyse bacterial diversity of a tropical soil using PCR and DGGE.$h[electronic resource] 260 $c2002 520 $aAim: To evaluate the rpoB gene as a biomarker for PCR-DGGE microbial analyses using soil DNA from the Cerrado, Brazil. Methods: DNA extraction from soil was followed by Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification of rpoB and 16S rRNA genes. PCR products were compared by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) to compare gene/community profiles. Results: The rpoB DGGE profiles comprised fewer bands than the 16S rDNA profiles and were easier to delineate and therefore to analyse. Comparison of the community profiles revealed that the methods were complementary. Conclusions, Significance and Impact of the Study: The gene for the beta subunit of the RNA polymerase, rpoB, is a single copy gene unlike 16S rDNA. Multiple copies of 16S rRNA genes in bacterial genomes complicate diversity assessments made from DGGE profiles. Using the rpoB gene offers a better alternative to the commonly used 16S rRNA gene for microbial community analyses based on DGGE. 650 $aPolymerase chain reaction 650 $aTropical soils 653 $aDNA extraction 700 1 $aCOUTINHO, H. L. da C. 700 1 $aRUMJANEK, N. G. 700 1 $aMACRAE, A. 700 1 $aROSADO, A. S. 773 $tLetters in Applied Microbiology$gv. 35, n. 4, p. 316-320, Oct. 2002.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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